Na operačním sále nejspíš skončíte, pokud hrozí zmiňované otočení vaječníku. Znepokojující je také to, pokud cysta sama nezmizí během tří menstruačních cyklů, je větší než 10 centimetrů nebo existuje podezření, že by mohlo jít o nádorové bujení. Operace se většinou provádí laparoskopicky s celkovou
Operace cysty na vaječníku a případná hysterektomie. Operace, kdy je cysta odstraněna i se svým obalem, zajistí, že cysta už se nebude dále tvořit. Bohužel však nezaručí, že se nevytvoří cysta jiná, na jiném místě. Operace se volí zejména u cyst, které jsou endometriální a které přímo způsobují ženinuPokud je plánován laparoskopický operační výkon – tj. laparoskopie operační (kdy se připojuje výkon např. na vaječníku, odstranění cysty, rozrušení srůstů apod.), je nutné provést další 2-3 drobné kožní řezy, kterými se zavádí další operační nástroje do dutiny břišní. Laparoskopie patří mezi tzv. xD0d.